利用物理因子作用于病原微生物，将之杀灭或清除，叫做物理消毒法。物理因子按其在消毒中的作用可分为5类：

1、具有良好灭菌作用的因子

    如热力、微波、红外线与电离辐射等。其中微波与红外线的作用主要依靠的仍然是产生的热。这一类物理因素杀灭微生物的能力很强，处理时较易达到灭菌要求，目前多已广泛用于实际工作，而且效果也非常理想。

2、具有一定消毒作用的因子

    如紫外线、超声波等。利用这些因素，可杀灭大部分微生物，但超声波的杀菌作用较弱。紫外线已广泛用于空气、物体表面及水的消毒。

3、具有自然净化作用的因子

    如日光照射、干燥等。它们杀灭微生物的能力有限，尽在自然净化中发挥作用。但是，它们是最方便、廉价的。

4、具有除菌作用的因子

    如清洗、机械清除、通风与过滤除菌等，虽不能杀灭微生物，但可将它们从传播媒介上去掉，因此仍不失为消毒措施中的有效方法，在卫生防疫工作中使用亦较为普遍。

5、具有辅助作用的因子

如真空、磁力、压力、光催化剂等，对微生物的杀灭、抑制或清除创造有利条件。例如，真空能去除容器中的氧气，有利于抑制某些微生物的生长与繁殖；磁水冲洗污垢，效果较好，有利于清除沾染的微生物；加压可促进药物的穿透，有利于缩短消毒时间。